Entièrement automatisée, la station fonctionne différemment selon le niveau de la Seine, et selon qu'il s'agit de temps sec ou de période de pluie.
Par temps sec ou pluie modérée
Les eaux usées sont refoulées après traitement (dégrillage, dessablage) vers la station d'épuration d'Achères, et ce grâce à des pompes d'une capacité de 163 litres par seconde. Un siphon permet de supporter facilement, par stockage temporaire, une petite augmentation du débit.